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CpG島分析工具(CpG Islands)

CpG島分析工具用于分析CpG島的潛在區(qū)域,分析算法請參考文獻Gardiner-Garden and Frommer (1987)。算法采用大小為200bp、步長為1的滑動窗口進行計算。CpG島是Obs/Exp值大于60%,GC含量大于50%的一段序列。期望值(Exp)=‘C’的出現(xiàn)次數(shù) * ‘G’的出現(xiàn)次數(shù) / 滑動窗口大小。CpG島一般出現(xiàn)在脊椎動物基因的5'端,所以此工具可以在基因組中標記出潛在基因。

輸入一條原始序列或者一到多條FASTA格式序列,長度限定在100000以內(nèi)

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